MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis RGTB327 chromosome

Total Repeats: 31928

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017026	TTC	2	6	1534	1539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017026	A	7	7	1553	1559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017026	TC	4	8	1562	1569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017026	CGG	2	6	1643	1648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017026	AC	4	8	1686	1693	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017026	CCGA	2	8	1725	1732	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017026	TCG	2	6	1801	1806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017026	ACC	2	6	1848	1853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017026	TCG	2	6	1866	1871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017026	ATG	2	6	1889	1894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017026	GTT	3	9	1925	1933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017026	CTG	2	6	1937	1942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017026	CGT	2	6	1950	1955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017026	TCG	2	6	1979	1984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017026	CGTC	2	8	3285	3292	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017026	TTG	2	6	3362	3367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017026	CGA	2	6	3416	3421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017026	TGC	3	9	4533	4541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017026	CG	5	10	4543	4552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017026	GTCGG	2	10	4590	4599	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017026	CGA	2	6	4612	4617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017026	GGT	2	6	4746	4751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017026	CCA	2	6	4755	4760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_017026	ACG	2	6	4794	4799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017026	CGC	2	6	4879	4884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_017026	CGG	2	6	4929	4934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017026	CG	3	6	4980	4985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017026	GAA	2	6	5093	5098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017026	AGA	2	6	5143	5148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017026	GTG	2	6	5176	5181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017026	GCG	2	6	5193	5198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017026	GAG	2	6	5224	5229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017026	CGA	3	9	9832	9840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017026	GAG	2	6	9861	9866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017026	TCG	2	6	10864	10869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017026	TCC	2	6	10949	10954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_017026	ACG	2	6	10979	10984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017026	GGC	2	6	11024	11029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017026	TCG	2	6	11032	11037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017026	CCT	2	6	11085	11090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_017026	CGA	2	6	11697	11702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017026	ACT	2	6	11744	11749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017026	CAT	2	6	11805	11810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017026	GAC	2	6	11866	11871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017026	GAGC	2	8	12096	12103	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017026	GGC	2	6	12112	12117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017026	CGG	2	6	12152	12157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017026	GAG	2	6	12214	12219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017026	CTCA	2	8	12307	12314	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017026	GCC	2	6	12319	12324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_017026	CGG	2	6	12399	12404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017026	GCCC	2	8	12457	12464	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
53	NC_017026	TCG	2	6	13038	13043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017026	CAC	2	6	13581	13586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_017026	CGACC	2	10	13676	13685	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
56	NC_017026	ATTC	2	8	13695	13702	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017026	CGG	2	6	13706	13711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017026	ACC	2	6	13849	13854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_017026	AGC	2	6	15374	15379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017026	GGT	2	6	17470	17475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017026	CG	4	8	17505	17512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017026	CGG	2	6	17523	17528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017026	C	6	6	23216	23221	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
64	NC_017026	GC	3	6	23232	23237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017026	TCG	2	6	23263	23268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017026	CG	3	6	23583	23588	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017026	CGG	2	6	23617	23622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017026	CAT	2	6	23625	23630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017026	CAA	2	6	23697	23702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017026	GGT	2	6	23826	23831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017026	CTC	2	6	24465	24470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_017026	CCG	2	6	24505	24510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_017026	GCC	2	6	24522	24527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_017026	GCC	2	6	24546	24551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_017026	GCCGG	2	10	24598	24607	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
76	NC_017026	AGG	2	6	24615	24620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017026	GCG	2	6	24635	24640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017026	C	6	6	24646	24651	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
79	NC_017026	GGCC	2	8	25567	25574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017026	CCG	2	6	25588	25593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_017026	CTA	2	6	25623	25628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017026	TCC	2	6	25640	25645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_017026	GTT	2	6	25647	25652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017026	TCG	3	9	25767	25775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017026	GCC	2	6	25781	25786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_017026	GC	3	6	25931	25936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017026	GC	3	6	25947	25952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017026	CGC	2	6	25956	25961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_017026	TTG	2	6	25962	25967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017026	CGG	2	6	25988	25993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017026	CGG	2	6	26030	26035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017026	GCA	2	6	26062	26067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017026	CTT	2	6	26093	26098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017026	GT	3	6	26167	26172	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017026	GTG	2	6	26212	26217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017026	GTC	2	6	26226	26231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017026	GCC	2	6	26239	26244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_017026	AGC	2	6	26245	26250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017026	CGG	2	6	26318	26323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017026	CGG	2	6	26339	26344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017026	CGG	2	6	26372	26377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017026	CG	3	6	26401	26406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017026	CGA	2	6	26417	26422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017026	CCA	2	6	26489	26494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_017026	GCTC	2	8	26518	26525	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017026	G	7	7	26568	26574	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017026	AGC	2	6	26655	26660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017026	TGA	2	6	26686	26691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017026	GCG	2	6	26715	26720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017026	CCAA	2	8	26737	26744	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017026	GCC	2	6	26759	26764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_017026	CAGC	2	8	26803	26810	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017026	CCG	2	6	26814	26819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_017026	CAC	2	6	26891	26896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_017026	AAC	2	6	26897	26902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017026	CGT	2	6	26915	26920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017026	CTT	2	6	26966	26971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017026	CGAGC	2	10	26983	26992	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
119	NC_017026	CCT	2	6	27465	27470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_017026	TA	3	6	27541	27546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017026	GTA	2	6	27580	27585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017026	AC	3	6	29675	29680	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017026	GCG	2	6	31098	31103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017026	ACCGCG	2	12	31104	31115	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017026	ACCA	2	8	31139	31146	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017026	CGG	2	6	31150	31155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017026	CAA	2	6	31185	31190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017026	GAG	2	6	31191	31196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017026	AC	3	6	32010	32015	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017026	CAC	2	6	32020	32025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_017026	GAT	2	6	32049	32054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017026	TGG	2	6	33214	33219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017026	G	6	6	33218	33223	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017026	CCGCC	2	10	33823	33832	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
135	NC_017026	GCTA	2	8	33870	33877	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017026	CGG	2	6	33929	33934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017026	GCG	2	6	33950	33955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017026	TGG	2	6	34011	34016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017026	CGG	2	6	34082	34087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017026	GGT	2	6	34144	34149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017026	CCA	2	6	34166	34171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_017026	G	6	6	34206	34211	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017026	TCA	2	6	38978	38983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017026	CG	3	6	38999	39004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017026	GC	3	6	39009	39014	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017026	CT	3	6	39048	39053	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_017026	CG	3	6	39055	39060	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_017026	GC	3	6	39065	39070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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151	NC_017026	GCC	2	6	41241	41246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_017026	GGT	2	6	41302	41307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_017026	CCG	3	9	41934	41942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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156	NC_017026	GCGTC	2	10	41959	41968	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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173	NC_017026	GTC	2	6	48630	48635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_017026	GGC	2	6	48638	48643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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177	NC_017026	GCCG	2	8	48719	48726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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184	NC_017026	GC	3	6	49099	49104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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271	NC_017026	GCC	3	9	59950	59958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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274	NC_017026	GCGG	2	8	60034	60041	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
275	NC_017026	CA	3	6	60137	60142	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
276	NC_017026	CAG	2	6	60170	60175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
277	NC_017026	GGT	2	6	60345	60350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
278	NC_017026	GCG	2	6	60357	60362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_017026	GGA	2	6	60411	60416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
280	NC_017026	TG	3	6	63061	63066	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
281	NC_017026	ATG	2	6	63100	63105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
282	NC_017026	CGG	2	6	63139	63144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_017026	CGT	2	6	63168	63173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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285	NC_017026	CCT	2	6	63967	63972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
286	NC_017026	CGC	2	6	64052	64057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
287	NC_017026	TCG	3	9	64125	64133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_017026	CAT	2	6	64162	64167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_017026	CCA	2	6	64176	64181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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291	NC_017026	GC	3	6	64447	64452	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
292	NC_017026	GCG	2	6	64471	64476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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294	NC_017026	CGC	2	6	64490	64495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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301	NC_017026	TGCCG	2	10	65519	65528	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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322	NC_017026	CTG	2	6	68904	68909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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423	NC_017026	TTGA	2	8	75741	75748	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
424	NC_017026	CTG	2	6	75754	75759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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